Pusat Standardisasi Instrumen Kualitas Lingkungan Hidup terdiri atas Bidang Perumusan dan Penilaian Kesesuaian Standar Instrumen, Bidang Pengembangan Standar Instrumen dan Pengelolaan Laboratorium dan Metrologi Lingkungan, Sub Bagian Tata Usaha dan Kelompok Jabatan Fungsional.